杨焕明

杨焕明


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个人简历

杨焕明,中国科学院(CAS)院士;中国医学科学院(CAMS)学术咨询委员会学部委员;中国科学院大学(UCAS)及中国协和医科大学(PUMC)教授;中国遗传学会和中国生物工程学会资深副理事长;中国城市科学研究会理事长;中国科学院北京基因组研究所和华大基因联合创始人。

杨焕明多年从事基因组学的科研和教学工作。他和他的华大团队及全球合作者一起参与了“国际人类基因组计划(HGP, 1999-2003)”,“国际人类单体型图计划(HapMap, 2002-2006)”、“国际千人基因组计划(G1K, 2008-2012)”、“国际癌症基因组计划(ICGP, 2008-2010)”,“国际酵母基因组重新设计和合成计划(Sc2.0,2011-)”和“地球生物基因组计划(EBP,2017 - )”等国际合作计划并任其协调组成员,以及水稻、家猪、家鸡、家蚕、熊猫以及SARS病毒等多项动植物、微生物的基因组计划。杨焕明已在国际学术杂志上发表论文690多篇,其中200余篇发表于Cell,Science,Nature及其系列杂志,H-index=140。

杨焕明还是欧洲分子生物学组织(EMBO)、发展中国家科学院(TWAS)和非洲科学院(AAS)成员,及丹麦、德国、印度、乌克兰、美国等国家科学院的国际/外籍院士。    


研究方向

1.肿瘤单细胞、时空等多组学解析和数据平台构建,解析癌症异质性、微环境及发生发展机制;
2.开发人工智能与多维大数据挖掘新算法与软件开发;
3.建立肿瘤类器官技术研发平台,开展再生医学及肿瘤相关问题研究;
4.搭建全基因组CRISPR基因编辑筛选平台,整合单细胞组学、时空组学、代谢组学等研究手段,为肿瘤大规模药物筛选和耐药性等研究提供重要工具;
5.建立生物智造技术研发中心,通过对底盘细胞代谢通路的改造,开展一碳到多碳的生物智造、新型抗癌药物设计与转化研究;    


承担科研项目情况

1.  大规模基因组生物信息学系统的建立(科技部国际合作项目,2002-2003),100万元,课题负责人
2.  家猪基因组计划(科技部国际合作项目,2002-2004),80万元,课题负责人
3. 癌症基因组研究——以新一代测序技术研究癌症的“组学”(国家863计划,2009-2011),3675万元,课题负责人
4. 人类基因组的策略及应用(NSFC创新研究群体科学基金,2003-2008),360万元,课题负责人
5. 基于分子标记的转移性乳腺癌个体化治疗(NSFC国际合作交流项目,2008-2011),100万元,课题负责人
6. 中丹乳腺癌中心延伸项目:基于分子标记的转移性乳腺癌个体化治疗(NSFC国际合作交流项目,2012-2014),250万元,课题负责人
7. 中印基因组信息学研讨会(NSFC国际合作交流项目,2004),1.3万元,课题负责人
8. 编写《生物科学方法研究》一书(科技部创新方法分册编写,2010),10万元,课题负责人
9. 国际肿瘤基因组创新研究团队(广东省引进创新团队项目,2010-2014),3000万元,课题负责人
10. 广东省首批引进创新科研团队配套资助—国际肿瘤基因组创新研究团队(深圳市孔雀计划(省创新科研团队配套),2010-2014),3000万元,课题负责人
11. 项目名称:1%人类基因组和中国重要战略资源生物基因在计划(中国科学院知识创新工程项目,1999-2002),2500万元,课题负责人
12. 家蚕基因组框架图和家鸡基因组多态性图谱的绘制(中国科学院知识创新工程重大项目,2003-2005),3500万元,课题负责人
13. 项目名称:生物信息学重大基础理论与应用研究;课题名称:有重要应用前景的动物、植物、微生物基因组的相关信息提取(中国科学院知识创新工程项目2000-2004),23万元,课题负责人
14. 海量生物信息数据综合处理平台(国家863计划,2001-2001),45万元,课题副组长
15. 炎黄计划(深圳市财政专款项目,2007-2008)2000万元,主要完成人之一
16. 人的遗传变异、DNA甲基化及胃肠道微生物基因组研究(深圳市财政专款项目2009-2010),2000万元,主要完成人之一
17. 深度设计基因组的功能重塑研究 2018YFA0900102(重点研发计划(合成生物学)),2019.07-2024.06,1215万元,其他研究人员。
18. 合成生物学科技政策、科学传播、公众参与的系统平台构建 2018YFA0902404(重点研发计划(合成生物学)),2019.07-2024.06,100万元,课题/项目骨干。
19. 中科院肿瘤与基础医学研究所共建生命组学中心(2021-),10000万元,课题负责人    


代表论著

1、杨焕明 著. “天”生与“人”生 - 生殖与克隆. 科学出版社. 第1版.  2008年3月
2、杨焕明.生命科学发展的历史缩影. 1-12 页. 徐熊 著.让生命之树常青—人类DNA揭秘.新华出版社. 第1版. 2003年1月
3、杨焕明 主编. 破解遗传密码. 北京少年儿童出版社/北京教育出版社.第1版.2002年9月
4、杨焕明, 深蓝, 张秀清, 汪建, 刘斯奇, 于军 著. 生命大解密: 人类基因组计划. 中国青年出版社. 第1版. 2000年4月
5、杨焕明. “人类基因组” 226-242页 (第12章). 李璞 主编. 医学遗传学. 中国协和医科大学出版社.第1版. 1999年5月
6、杨焕明. 普通高中课程标准实验教科书(必修):生物(第二册):“我赞叹生命的美丽 — 与杨焕明教授一席谈”.  人民教育出版社. 第1版. 2004年5月
7、杨焕明. 主译 基因的分子生物学 第7版. 科学出版社. 2015年3月
8、杨焕明.  生物科学研究方法丛书 基因组学方法. 科学出版社. 2015年12月
9、杨焕明.  基因组学 2016版. 科学出版社. 2016年10月
10、杨焕明.  基因脸谱 科学出版社. 2021年
11、杨焕明. 运动生理学彩色图谱. 科学出版社 2023年
12、杨焕明. 生命是什么 湖南科技出版社 2023年    


获奖及荣誉

获奖:
1、深圳市科学技术奖(自然科学类一等奖)(2022):酵母长染色的定制合成与应用
2、国家“创新争先奖”奖章 (2017):(科技部、人社部、中国科协、国资委
3、卓越科学成就奖 (2010):国际人类基因组组织
4、中国科学十大进展 (2017):科技部,2017年)
5、广东省科学技术奖励一等奖(2016):泌尿系统恶性肿瘤的基因组学研究 
6、国家自然科学二等奖(2016):泌尿系统恶性肿瘤基因组学研究
7、教育部自然科学二等奖 (2019):多疣壁虎断尾再生研究
8、青海省科学技术二等奖(2013):藏羚羊高原适应生物学机制的研究
9、深圳市自然科学一等奖(2018):国际鸟类生命之树研究计划
10、国家科学技术进步二等奖(2012):“天生”与“人生”:生殖与克隆
11、中华人民共和国国家专利优秀奖 (2016):一种组装基因组的方法,第一完成人:杨焕明1. 杨焕明。一种制备重组脱氧核糖核酸酶I的方法。中国发明专利:ZL 01 1 01653.1
12、卓越科学成就奖 (2010):国际人类基因组组织
13、2003年度中国科学院杰出成就科技奖 — “中国杂交水稻基因组计划研究项目”(2004年)
14、国家自然科学奖二等奖(集体)—“国际人类基因组计划1%基因组测序项目”(2002年)
15、“香港求是科技基金会”“杰出科技成就集体奖” — 完成水稻基因组和建立中国基因组分析基地(2002年)
16、获科技部863计划“先进集体称号”— 1%人类基因组计划项目(2001年)
专利:
1. 一种耐高温异柠檬酸脱氢酶基因序列及编码的多肽和制备方法。中国发明专利:ZL 01 1 45589.6;
2. 一种基于重复序列识别的全基因组测序数据的拼接方法。中国发明专利:ZL 01 1 34851.8;
3. 检测SARS冠状病毒抗体的方法及其试剂盒。中国发明专利:ZL 03 1 16661.X;