核酸适体筛选中心

一、研究中心简介

核酸适体筛选中心是依托中国科学院杭州医学研究所建立的全球首个核酸适体筛选及新药研发技术平台。创始人谭蔚泓院士一直从事核酸适体筛选与生物医学应用。筛选中心致力于开发高通量低成本的新一代筛选技术,快速获得高品质核酸适体,通过原创性技术与理论研究提升核酸适体性能,推动核酸适体在分子诊断、靶向治疗、细胞图谱、蛋白质组学等生物医药领域的应用,为核酸适体基础研究、临床应用、产业转化提供全面、优质的服务。中心致力于成为全球核酸适体领域的筛选中心、研究中心、培训中心和产业转化中心。推动核酸适体领域的科研和产业转化,让核酸适体成为建设健康中国,服务于人民生命健康的重要工具。

二、研究方向及内容

研究方向1:核酸适体筛选

针对蛋白、小分子、多糖、细胞、组织等生物医学靶标筛选获得高亲和力、高特异性的核酸适体。开发下一代筛选技术,包括针对微量靶标的筛选方法,如单细胞单轮筛选技术;针对大量靶标的高通量自动化筛选技术;基于人工智能的虚拟筛选技术等。同时,建立基于核酸适体的新靶标发现与鉴定新方法,探索核酸适体功能与结构的关系,提高核酸适体稳定性、亲和力、特异性。

研究方向2:核酸适体生物医学应用

基于核酸适体优异的分子识别特性,聚焦核酸适体在分子诊断、疾病治疗中的基础研究与临床转化。开发核酸适体分子探针,用于传染病POCT检测,临床血液检测、生物样本成像等;基于核酸适体库绘制单细胞数字化分子图谱,建立肿瘤等疾病分子诊断新模式;发展基于核酸适体的细胞血液蛋白质组学技术,用于肿瘤早期诊断;开发核酸适体偶联药物、偶联核素等新型靶向药物,实现肿瘤精准诊断与治疗。

中心拥有建筑面积1600平米的实验空间,平台配有十余位经验丰富的核酸适体筛选及应用专业技术人员,具备核酸适体筛选、表征及优化的全流程服务能力,能够高水平完成核酸适体筛选及表征,配备有核酸适体等功能核酸研究所需的各类先进仪器设备,总价值超过3000万元。仪器包括高通量分子相互作用分析仪、高通量测序仪、流式细胞仪、数字PCR、等温滴定微量热仪、毛细管电泳仪、单细胞分选仪、核酸片段分析仪,以及自主搭建的全自动高通量核酸适体筛选仪等设备。

三、研究团队

中国科学院杭州医学研究所核酸适体筛选中心是全球首个专业的核酸适体筛选中心,拥有一支在该领域有影响力的科研团队。现有固定研究人员13人。其中研究员4名,副研究员1名,高级工程师1名,技术人员7人。团队中有院士1人,国家级青年人才1人,浙江省人才卫生创新人才培养对象2人,另有硕博士研究生数十人。已经建成一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队与技术支撑队伍。

主要研究团队:

团队一:核酸适体筛选,包括核酸适体高通量自动化筛选、核酸适体细胞筛选两大方向。张鹏晖研究员为课题组长,主要成员包括罗昭锋研究员,邴涛研究员等。

团队二:核酸适体应用,包括核酸适体偶联药物、基于核酸适体的单细胞数字化分子图谱两大方向。谭蔚泓院士为课题组长,主要成员包括何嘉轩高级工程师、武晓秋博士等。

四、研究成果

发表论文

1.Youjuan Wang, Zhigao Yi, Jing Guo, Shiyi Liao, Zhe Li, Shuai Xu, Baoli Yin, Yongchao Liu, Yurong Feng, Qiming Rong, Xiaogang Liu, Guosheng Song*, Xiao-Bing Zhang*, Weihong Tan*. In vivo ultrasound-induced luminescence molecular imaging. Nature Photonics, 2024, 1-10.

2.Yulin Du, Yifan Lyu, Jie Lin, Chunran Ma, Qiang Zhang, Yutong Zhang, Liping Qiu*, Weihong Tan*. Membrane-anchored DNA nanojunctions enable closer antigen-presenting cell–T-cell contact in elevated T-cell receptor triggering. Nature Nanotechnology, 2023, 18(7), 818-827.

3.Jin Li, Yingying Li, Qin Li, Lu Sun, Qingqing Tan, Liyan Zheng, Ye Lu, Jianqing Zhu, Fengli Qu*, Weihong Tan*. An Aptamer‐Based Nanoflow Cytometry Method for the Molecular Detection and Classification of Ovarian Cancers through Profiling of Tumor Markers on Small Extracellular Vesicles. Angewandte Chemie International Edition, 2024, 63(4), e202314262.

4.Xiaoxue Hu, Hongli Chi, Xiaoyi Fu, Jinling Chen, Linying Dong, Shiqi Jiang, Yan Li, Jinling Chen, Ming Cheng, Qianhao Min *, Ye Tian *, Penghui Zhang*. Journal of the American Chemical Society, 2024, 146, 2514-2523.

5.Keli An, Xuqian Deng, Hongli Chi, Yuchao Zhang, Yan Li, Ming Cheng, Zhigang Ni, Zhi Yang, Chao Wang, Jinling Chen, Jianbo Bai, Chunyan Ran, Yong Wei, Juan Li, Penghui Zhang *, Feng Xu *, Weihong Tan*. Angewandte Chemie International Edition, 2023, 62, 02306824.

6.Penghui Zhang, Di Gao, Keli An, Qi Shen, Chen Wang, Yuchao Zhang, Xiaoshu Pan, Xigao Chen, Yifan Lyv, Cheng Cui, Tingxizi Liang, Xiaoman Duan, Jie Liu, Tielin Yang, Xiaoxiao Hu, Jun-Jie Zhu*, Feng Xu*, Weihong Tan*. Nature Chemistry, 2020, 12, 381-390.

7.Mengdi Yu, Xiaohui Zhang, Xin Zhang, Qurat ul ain Zahra, Zenghui Huang, Ying Chen, Chunxia Song, Min Song, Hongjuan Jiang, Zhaofeng Luo*, Ying Lu*. An electrochemical aptasensor with N protein binding aptamer-complementary oligonucleotide as probe for ultra-sensitive detection of COVID-19. Biosensors and Bioelectronics, 2022, 213: 114436.

8.Xiaona Fang, Wenjing Li, Tian Gao, Qurat Ul Ain Zahra, Zhaofeng Luo*, Renjun Pei*. Rapid screening of aptamers for fluorescent targets by integrated digital PCR and flow cytometry. Talanta, 2022, 242: 123302.

授权专利

1.用于递送活性成分的脂质分子及其组合物的制备和应用;ZL 202210829701.0;谭蔚泓,张鹏晖,李岩,邓旭倩,符婷,谢斯滔,甘绍举,刘湘圣,程明,逯良伟。

2.新冠病毒全长核衣壳蛋白DNA核酸适体的体外筛选方法;ZL 202210814265.X;谭蔚泓,宋明慧,方晓娜,罗昭锋。

3.用于检测病原微生物的多核酸适体及其组合;ZL 202210754831.2;谭蔚泓,杨秋霞,付晓艺,彭瑞资,李恒轩,宋明慧,罗昭锋,符婷。

4.一种双价可电离脂质化合物、组合物及其应用;ZL 202210159490.4;谭蔚泓,张鹏晖,李岩,邓旭倩,符婷,谢斯滔,甘绍举。

5.一种结合DKK1蛋白的核酸适配体及其应用;ZL 202210375121.9;罗昭锋,张峥,方晓娜,何嘉轩,贾浩然,陈敏。

五、联系与合作

筛选中心的愿景是促进全球该领域的发展,为广大的科研工作者、相关企业提供相应的技术支持和服务。包括委托筛选、技术培训、项目合作等。如果您对筛选中心研究工作感兴趣或想合作,请随时联系我们。

张鹏晖 email:phzhang@ucas.ac.cn,电话: 15809277537

罗昭锋 email:luozhaofeng@him.cas.cn

邴涛 email:bingtao@him.cas.cn 

筛选中心服务邮箱:aptamer@him.cas.cn; 0571-8812 1289


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    核酸适体筛选中心

    一、研究中心简介

    核酸适体筛选中心是依托中国科学院杭州医学研究所建立的全球首个核酸适体筛选及新药研发技术平台。创始人谭蔚泓院士一直从事核酸适体筛选与生物医学应用。筛选中心致力于开发高通量低成本的新一代筛选技术,快速获得高品质核酸适体,通过原创性技术与理论研究提升核酸适体性能,推动核酸适体在分子诊断、靶向治疗、细胞图谱、蛋白质组学等生物医药领域的应用,为核酸适体基础研究、临床应用、产业转化提供全面、优质的服务。中心致力于成为全球核酸适体领域的筛选中心、研究中心、培训中心和产业转化中心。推动核酸适体领域的科研和产业转化,让核酸适体成为建设健康中国,服务于人民生命健康的重要工具。

    二、研究方向及内容

    研究方向1:核酸适体筛选

    针对蛋白、小分子、多糖、细胞、组织等生物医学靶标筛选获得高亲和力、高特异性的核酸适体。开发下一代筛选技术,包括针对微量靶标的筛选方法,如单细胞单轮筛选技术;针对大量靶标的高通量自动化筛选技术;基于人工智能的虚拟筛选技术等。同时,建立基于核酸适体的新靶标发现与鉴定新方法,探索核酸适体功能与结构的关系,提高核酸适体稳定性、亲和力、特异性。

    研究方向2:核酸适体生物医学应用

    基于核酸适体优异的分子识别特性,聚焦核酸适体在分子诊断、疾病治疗中的基础研究与临床转化。开发核酸适体分子探针,用于传染病POCT检测,临床血液检测、生物样本成像等;基于核酸适体库绘制单细胞数字化分子图谱,建立肿瘤等疾病分子诊断新模式;发展基于核酸适体的细胞血液蛋白质组学技术,用于肿瘤早期诊断;开发核酸适体偶联药物、偶联核素等新型靶向药物,实现肿瘤精准诊断与治疗。

    中心拥有建筑面积1600平米的实验空间,平台配有十余位经验丰富的核酸适体筛选及应用专业技术人员,具备核酸适体筛选、表征及优化的全流程服务能力,能够高水平完成核酸适体筛选及表征,配备有核酸适体等功能核酸研究所需的各类先进仪器设备,总价值超过3000万元。仪器包括高通量分子相互作用分析仪、高通量测序仪、流式细胞仪、数字PCR、等温滴定微量热仪、毛细管电泳仪、单细胞分选仪、核酸片段分析仪,以及自主搭建的全自动高通量核酸适体筛选仪等设备。

    三、研究团队

    中国科学院杭州医学研究所核酸适体筛选中心是全球首个专业的核酸适体筛选中心,拥有一支在该领域有影响力的科研团队。现有固定研究人员13人。其中研究员4名,副研究员1名,高级工程师1名,技术人员7人。团队中有院士1人,国家级青年人才1人,浙江省人才卫生创新人才培养对象2人,另有硕博士研究生数十人。已经建成一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队与技术支撑队伍。

    主要研究团队:

    团队一:核酸适体筛选,包括核酸适体高通量自动化筛选、核酸适体细胞筛选两大方向。张鹏晖研究员为课题组长,主要成员包括罗昭锋研究员,邴涛研究员等。

    团队二:核酸适体应用,包括核酸适体偶联药物、基于核酸适体的单细胞数字化分子图谱两大方向。谭蔚泓院士为课题组长,主要成员包括何嘉轩高级工程师、武晓秋博士等。

    四、研究成果

    发表论文

    1.Youjuan Wang, Zhigao Yi, Jing Guo, Shiyi Liao, Zhe Li, Shuai Xu, Baoli Yin, Yongchao Liu, Yurong Feng, Qiming Rong, Xiaogang Liu, Guosheng Song*, Xiao-Bing Zhang*, Weihong Tan*. In vivo ultrasound-induced luminescence molecular imaging. Nature Photonics, 2024, 1-10.

    2.Yulin Du, Yifan Lyu, Jie Lin, Chunran Ma, Qiang Zhang, Yutong Zhang, Liping Qiu*, Weihong Tan*. Membrane-anchored DNA nanojunctions enable closer antigen-presenting cell–T-cell contact in elevated T-cell receptor triggering. Nature Nanotechnology, 2023, 18(7), 818-827.

    3.Jin Li, Yingying Li, Qin Li, Lu Sun, Qingqing Tan, Liyan Zheng, Ye Lu, Jianqing Zhu, Fengli Qu*, Weihong Tan*. An Aptamer‐Based Nanoflow Cytometry Method for the Molecular Detection and Classification of Ovarian Cancers through Profiling of Tumor Markers on Small Extracellular Vesicles. Angewandte Chemie International Edition, 2024, 63(4), e202314262.

    4.Xiaoxue Hu, Hongli Chi, Xiaoyi Fu, Jinling Chen, Linying Dong, Shiqi Jiang, Yan Li, Jinling Chen, Ming Cheng, Qianhao Min *, Ye Tian *, Penghui Zhang*. Journal of the American Chemical Society, 2024, 146, 2514-2523.

    5.Keli An, Xuqian Deng, Hongli Chi, Yuchao Zhang, Yan Li, Ming Cheng, Zhigang Ni, Zhi Yang, Chao Wang, Jinling Chen, Jianbo Bai, Chunyan Ran, Yong Wei, Juan Li, Penghui Zhang *, Feng Xu *, Weihong Tan*. Angewandte Chemie International Edition, 2023, 62, 02306824.

    6.Penghui Zhang, Di Gao, Keli An, Qi Shen, Chen Wang, Yuchao Zhang, Xiaoshu Pan, Xigao Chen, Yifan Lyv, Cheng Cui, Tingxizi Liang, Xiaoman Duan, Jie Liu, Tielin Yang, Xiaoxiao Hu, Jun-Jie Zhu*, Feng Xu*, Weihong Tan*. Nature Chemistry, 2020, 12, 381-390.

    7.Mengdi Yu, Xiaohui Zhang, Xin Zhang, Qurat ul ain Zahra, Zenghui Huang, Ying Chen, Chunxia Song, Min Song, Hongjuan Jiang, Zhaofeng Luo*, Ying Lu*. An electrochemical aptasensor with N protein binding aptamer-complementary oligonucleotide as probe for ultra-sensitive detection of COVID-19. Biosensors and Bioelectronics, 2022, 213: 114436.

    8.Xiaona Fang, Wenjing Li, Tian Gao, Qurat Ul Ain Zahra, Zhaofeng Luo*, Renjun Pei*. Rapid screening of aptamers for fluorescent targets by integrated digital PCR and flow cytometry. Talanta, 2022, 242: 123302.

    授权专利

    1.用于递送活性成分的脂质分子及其组合物的制备和应用;ZL 202210829701.0;谭蔚泓,张鹏晖,李岩,邓旭倩,符婷,谢斯滔,甘绍举,刘湘圣,程明,逯良伟。

    2.新冠病毒全长核衣壳蛋白DNA核酸适体的体外筛选方法;ZL 202210814265.X;谭蔚泓,宋明慧,方晓娜,罗昭锋。

    3.用于检测病原微生物的多核酸适体及其组合;ZL 202210754831.2;谭蔚泓,杨秋霞,付晓艺,彭瑞资,李恒轩,宋明慧,罗昭锋,符婷。

    4.一种双价可电离脂质化合物、组合物及其应用;ZL 202210159490.4;谭蔚泓,张鹏晖,李岩,邓旭倩,符婷,谢斯滔,甘绍举。

    5.一种结合DKK1蛋白的核酸适配体及其应用;ZL 202210375121.9;罗昭锋,张峥,方晓娜,何嘉轩,贾浩然,陈敏。

    五、联系与合作

    筛选中心的愿景是促进全球该领域的发展,为广大的科研工作者、相关企业提供相应的技术支持和服务。包括委托筛选、技术培训、项目合作等。如果您对筛选中心研究工作感兴趣或想合作,请随时联系我们。

    张鹏晖 email:phzhang@ucas.ac.cn,电话: 15809277537

    罗昭锋 email:luozhaofeng@him.cas.cn

    邴涛 email:bingtao@him.cas.cn 

    筛选中心服务邮箱:aptamer@him.cas.cn; 0571-8812 1289


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