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医学所概况

生物治疗与组学中心

一、研究中心简介

生物治疗与组学研究中心依托医学所与肿瘤医院的临床资源和科研优势，以“前沿引领、交叉融合、转化创新”为核心理念，致力于打造国际一流的生物医学研究平台。中心主要聚焦于基因编辑、细胞治疗、肿瘤靶向免疫、核酸化学与合成生物学、单细胞与空间多组学整合及智能分子诊疗等核心领域，致力于推动基础研究向临床转化的全链条创新。中心汇聚了多个高水平研究团队，通过多学科交叉融合，打造从底层技术开发到疾病精准诊疗的一体化研究体系，是一个跨学科、前沿性的科研创新平台。

二、研究方向及内容

1. 肿瘤多组学与单细胞/空间组学研究：整合多维度数据解析重大疾病发生发展机制。

2. 基因编辑技术体系优化与创新：开发高精度、低毒性、高活性的新型基因编辑工具，包括小型化基因编辑系统。

3. 基因与细胞治疗新策略：基于自主创新的基因编辑工具，开展基因治疗与细胞治疗的临床前研究。

4. 干细胞定向分化与疾病建模：人多能干细胞定向分化与谱系重编程、细胞替代治疗与疾病模型构建。

5. 抗肿瘤新药基础转化及临床研究：聚焦药物作用机制、信号通路调控及免疫微环境重塑；开展创新药物筛选与评价，推动治疗研发与临床转化。

6. 纳米蛋白组学驱动的精准诊断与治疗：纳米蛋白组学、DNA核酸适体智能诊断、机器学习、纳米医学等基于纳米技术的分子诊断及癌症治疗。

7. 非天然核酸设计与应用：开发功能性核酸分子用于生物医学。

三、团队介绍

中国科学院杭州医学研究所生物治疗与组学中心拥有一支在领域内有影响力的科研团队，现有固定人员8人，其中研究员5人，副研究员2人，助理研究员1人，除此之外中心还有兼职人员11人。科研团队中有院士1人、国家杰青1人、国家级青年人才2人及省级人才多人。中心组建了一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队和管理队伍。

主要研究团队：

团队一：生命组学团队

团队聚焦恶性肿瘤等重大疾病研究，通过整合基因组学、蛋白质组学、空间转录组学及游离核酸检测等多组学技术，突破生物信息学关键技术瓶颈，深入解析疾病发生发展机制，助力靶点发现和药物研发。致力于构建覆盖全组学、多维度研究肿瘤等重大疾病的标准化技术平台与系统化研究体系。

杨焕明院士为团队负责人，主要成员包括刘斯奇、孙中生、董伟、吴逵、吴建民、张懿、任艳等人。

团队二：基因治疗/细胞治疗全链条创新

团队致力于构建基因治疗及细胞治疗的完整创新链条：一方面通过持续创新基因编辑工具，快速建立遗传疾病动物模型；另一方面基于创新工具和动物模型，着力开发临床可行的治疗策略和技术体系。打造从底层基因编辑技术研发出发，贯通基因治疗和细胞治疗的全流程创新，最终推动基因编辑技术的临床转化应用，打造具有国际竞争力的生物治疗研发平台。

李大力研究员为团队负责人，主要成员包括杨磊副研究员等人。

团队三：纳米蛋白组学及核酸适体智能分子诊疗

以纳米蛋白组学技术为核心，以蛋白质组学大数据驱动的人工智能为手段，以核酸适体识别元件为检测工具，致力于加速血液蛋白标志物的发现和大规模人群队列癌症的快速、智能、精准筛查。

刘远研究员为团队负责人，主要成员包括田小波副研究员、博士后以及研究生等人。

团队四：干细胞命运调控与细胞替代治疗

团队致力于以人多能干细胞定向分化和谱系重编程为平台，结合化学基因组学技术和基因编辑技术，研究人体细胞命运决定和功能维持的机理，以实现人体细胞的体外大规模制备、疾病模型构建和细胞替代治疗。

杜媛媛研究员为团队负责人，主要成员包括博士后、研究生和科研助理等人。

团队五：肿瘤靶向及免疫新药的基础和临床研究

专注于从药物作用机制、信号通路调控、免疫微环境重塑等基础研究，到创新药物筛选、药效学评价、安全性评估及转化医学研究，并积极推进早期临床试验。团队致力于探索更精准、有效的肿瘤治疗策略，推动肿瘤靶向与免疫治疗领域的突破性进展。

宋正波研究员为团队负责人，主要成员包括博士后、研究生和科研助理等人。

团队六：功能性非天然核酸设计合成及其生物医学应用研究

致力于化学生物学与合成生物学交叉领域的研究，核心目标是系统探索核酸的化学与生物学特性，开发核酸分子的大规模、精准生物合成与修饰平台，并推动其在药物研发与生物技术中的应用。

王雅俊研究员为团队负责人，主要成员包括博士后，研究生和科研助理等人。

四、研究成果：

1、 Nunes L, Li F, Wu  M, Luo T, Hammarström K, Torell E, Ljuslinder I, Mezheyevski A, Edqvist P-H, Löfgren-Burström A, Zingmark C, Edin S, Larsson C, Mathot L, Osterman E, Osterlund E, Ljungström V, Neves I, Yacoub N, ... Sjöblom T.  Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers. Nature, 2024，633, 137-146.

2、 Yin J, Yuan J, Li Y, Fang Y, Wang R, Jiao H, Tang H, Zhang S, Lin S, Su F, Gu J, Jiang T, Lin D, Huang Z, Du C, Wu K, Tan L, & Zhou Q. Neoadjuvant adebrelimab in locally advanced resectable esophageal squamous cell carcinoma: A phase 1b trial. Nature Medicine, 2023, 29(8), 2068–2078.

3、Wang S, Du Y, Zhang B, Meng G, Liu Z, Liew SY, Liang R, Zhang Z, Cai X, Wu S, Gao W, Zhuang D, Zou J, Huang H, Wang M, Wang X, Wang X, Liang T, Liu T, Gu J, Liu N, Wei Y, Ding X, Pu Y, Zhan Y, Luo Y, Sun P, Xie S, Yang J, Weng Y, Zhou C, Wang Z, Wang S, Deng H, Shen Z. Transplantation of chemically induced pluripotent stem-cell-derived islets under abdominal anterior rectus sheath in a type 1 diabetes patient. Cell. 2024 Oct 31;187(22):6152-6164.e18.

4、  Hua H, Wang Y, Wang X, Wang S, Zhou Y, Liu Y, Liang Z, Ren H, Lu S, Wu S, Jiang Y, Pu Y, Zheng X, Tang C, Shen Z, Li C, Du Y, Deng H. Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells. Cell Stem Cell. 2024 Jun 6;31(6):850-865.e10.

5、 Qiqi Liu, Mengjie Wang, Xin Dai, Shuangqin Li, Haoxiang Guo, Haozhe Huang, Yueli Xie, Chenlu Xu, Yuan Liu*, WeihongTan. Extreme Tolerance of Nanoparticle-Protein Corona to Ultra-High Abundance Proteins Enhances the Depth of Serum Proteomics. Adv. Sci. 2025,2413713

6、Yueli Xie, Mengjie Wang, Haoxiang Guo, Baichuan Jin,Chenlu Xu,Xin Dai,Yiyang Fu, Ze Wang, Weizhao Yao, Yuan Liu*, WeihongTan. Protein denaturation for in-depth serum proteome profiling and enhanced cancer diagnosis. Nano Today,2024,59,102488.

7、Shuangqin Li, Baichuan Jin, Yintao Ma, Xu Yang, Jinlong Fan, Yueli Xie, Chenlu Xu, Xin Dai, Mengjie Wang, Qiqi Liu, Ting Fu, Yuan Liu*, Weihong Tan*. Proteome Fishing for CRISPR/Cas12a-Based Orthogonal Multiplex Aptamer Sensing. J. Am. Chem. Soc. 2024,146,19874.

8、Lichao Wang, Xu Yang, Yueli Xie, Chenlu Xu, Xin Dai, Mengjie Wang,Yuan Liu*. Nanoparticle protein Corona-Based Tissue Proteomics for the Aging Mouse Proteome Atlas. Anal. Chem. 2024,96,14363.

9、Mengjie Wang, Xin Dai, Xu Yang, Baichuan Jin, Yueli Xie, Chenlu Xu, Qiqi liu, Lichao Wang, Lisha Ying,Weishan Lu,Qixun Chen,Ting Fu,Dan Su*,Yuan Liu*,and Weihong Tan*. Serum Protein Fishing for Machine Learning Boosted Diagnostic Classification of Small Nodules of Lung. ACS Nano. 2024,18,4038.

10、Ziming Li; SHR-A1811 (antibody-drug conjugate) in advanced HER2-mutant non-small cell lung cancer: a multicenter, open-label, phase 1/2 study, Signal Transduction and Targeted Therapy, 2024,9(1)

11、Gao, M.; Liu, Y.; Zhao, L.; Chen, J.; Wan, W.; Yuan, Z.; Li, L.; Huang, Y.; Wang, Y.; Zheng, Y. Cell Surface-Tethered Nucleic Acid Therapeutics Program Robust and Tumor-Responsive Enhancement of Adoptive Cell Therapy. Adv. Mater. 2025, e2419969.

12、Liu, Y.; Zhang, S.; Zhang, M.; Liu, X.; Wu, Y.; Wu, Q.; Chaput, J. C.; Wang, Y. Chemical Evolution of ASO-like DNAzymes for Effective and Extended Gene Silencing in Cells. Nucleic Acids Res. 2025, 53 (5), gkaf144.

13、Liu, Y.; Wang, J.; Wu, Y.; Wang, Y. Advancing the Enzymatic Toolkit for 2′-Fluoro Arabino Nucleic Acid (FANA) Manipulation: Phosphorylation, Ligation, Replication, and Templating RNA Transcription. Chem. Sci. 2024, 15 (31), 12534–12542.

14、Li Z, Song Z, Zhao Y, Wang P, Jiang L, Gong Y, Zhou J, Jian H, Dong X, Zhuang W, Cang S, Yang N, Fang J, Shi J, Lu J, Ma R, Wu P, Zhang Y, Song M, Xu CW, Shi Z, Zhang L, Wang Y, Wang X, Zhang Y, Lu S. D-1553 (garsorasib), a Potent and Selective Inhibitor of KRASG12C in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer: Phase I Study Results. J Thorac Oncol. 2023 Mar 20:S1556-0864(23)00196-X.

15、 Song Z, Li Y, Chen S, Ying S, Xu S, Huang J, Wu D, Lv D, Bei T, Liu S, Huang X, Xie C, Wu X, Fu J, Hua F, Wang W, Xu C, Gao C, Cai S, Lu S, Zhang Y. Efficacy and safety of pyrotinib in advanced lung adenocarcinoma with HER2 mutations: a multicenter, single-arm, phase II trial. BMC Med. 2022 Feb 1;20(1):42. 

五、联系与合作

如果您对我们的研究中心感兴趣或想与我们合作，请随时联系我们。您可以通过以下方式与我们取得联系：

刘远：liuyuan@him.cas.cn；

杜媛媛：qinjiangjiang@him.cas.cn；

宋正波：songzb@zjcc.org.cn；

王雅俊：wangyajun@him.cas.cn；

杨磊：yanglei@him.cas.cn；

董伟：omics@ibmc.ac.cn；


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    人才招聘
    科学研究
    招生教育
    新闻动态
    党群文化
    信息公开

    生物治疗与组学中心

    一、研究中心简介

    生物治疗与组学研究中心依托医学所与肿瘤医院的临床资源和科研优势，以“前沿引领、交叉融合、转化创新”为核心理念，致力于打造国际一流的生物医学研究平台。中心主要聚焦于基因编辑、细胞治疗、肿瘤靶向免疫、核酸化学与合成生物学、单细胞与空间多组学整合及智能分子诊疗等核心领域，致力于推动基础研究向临床转化的全链条创新。中心汇聚了多个高水平研究团队，通过多学科交叉融合，打造从底层技术开发到疾病精准诊疗的一体化研究体系，是一个跨学科、前沿性的科研创新平台。

    二、研究方向及内容

    1. 肿瘤多组学与单细胞/空间组学研究：整合多维度数据解析重大疾病发生发展机制。

    2. 基因编辑技术体系优化与创新：开发高精度、低毒性、高活性的新型基因编辑工具，包括小型化基因编辑系统。

    3. 基因与细胞治疗新策略：基于自主创新的基因编辑工具，开展基因治疗与细胞治疗的临床前研究。

    4. 干细胞定向分化与疾病建模：人多能干细胞定向分化与谱系重编程、细胞替代治疗与疾病模型构建。

    5. 抗肿瘤新药基础转化及临床研究：聚焦药物作用机制、信号通路调控及免疫微环境重塑；开展创新药物筛选与评价，推动治疗研发与临床转化。

    6. 纳米蛋白组学驱动的精准诊断与治疗：纳米蛋白组学、DNA核酸适体智能诊断、机器学习、纳米医学等基于纳米技术的分子诊断及癌症治疗。

    7. 非天然核酸设计与应用：开发功能性核酸分子用于生物医学。

    三、团队介绍

    中国科学院杭州医学研究所生物治疗与组学中心拥有一支在领域内有影响力的科研团队，现有固定人员8人，其中研究员5人，副研究员2人，助理研究员1人，除此之外中心还有兼职人员11人。科研团队中有院士1人、国家杰青1人、国家级青年人才2人及省级人才多人。中心组建了一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队和管理队伍。

    主要研究团队：

    团队一：生命组学团队

    团队聚焦恶性肿瘤等重大疾病研究，通过整合基因组学、蛋白质组学、空间转录组学及游离核酸检测等多组学技术，突破生物信息学关键技术瓶颈，深入解析疾病发生发展机制，助力靶点发现和药物研发。致力于构建覆盖全组学、多维度研究肿瘤等重大疾病的标准化技术平台与系统化研究体系。

    杨焕明院士为团队负责人，主要成员包括刘斯奇、孙中生、董伟、吴逵、吴建民、张懿、任艳等人。

    团队二：基因治疗/细胞治疗全链条创新

    团队致力于构建基因治疗及细胞治疗的完整创新链条：一方面通过持续创新基因编辑工具，快速建立遗传疾病动物模型；另一方面基于创新工具和动物模型，着力开发临床可行的治疗策略和技术体系。打造从底层基因编辑技术研发出发，贯通基因治疗和细胞治疗的全流程创新，最终推动基因编辑技术的临床转化应用，打造具有国际竞争力的生物治疗研发平台。

    李大力研究员为团队负责人，主要成员包括杨磊副研究员等人。

    团队三：纳米蛋白组学及核酸适体智能分子诊疗

    以纳米蛋白组学技术为核心，以蛋白质组学大数据驱动的人工智能为手段，以核酸适体识别元件为检测工具，致力于加速血液蛋白标志物的发现和大规模人群队列癌症的快速、智能、精准筛查。

    刘远研究员为团队负责人，主要成员包括田小波副研究员、博士后以及研究生等人。

    团队四：干细胞命运调控与细胞替代治疗

    团队致力于以人多能干细胞定向分化和谱系重编程为平台，结合化学基因组学技术和基因编辑技术，研究人体细胞命运决定和功能维持的机理，以实现人体细胞的体外大规模制备、疾病模型构建和细胞替代治疗。

    杜媛媛研究员为团队负责人，主要成员包括博士后、研究生和科研助理等人。

    团队五：肿瘤靶向及免疫新药的基础和临床研究

    专注于从药物作用机制、信号通路调控、免疫微环境重塑等基础研究，到创新药物筛选、药效学评价、安全性评估及转化医学研究，并积极推进早期临床试验。团队致力于探索更精准、有效的肿瘤治疗策略，推动肿瘤靶向与免疫治疗领域的突破性进展。

    宋正波研究员为团队负责人，主要成员包括博士后、研究生和科研助理等人。

    团队六：功能性非天然核酸设计合成及其生物医学应用研究

    致力于化学生物学与合成生物学交叉领域的研究，核心目标是系统探索核酸的化学与生物学特性，开发核酸分子的大规模、精准生物合成与修饰平台，并推动其在药物研发与生物技术中的应用。

    王雅俊研究员为团队负责人，主要成员包括博士后，研究生和科研助理等人。

    四、研究成果：

    1、 Nunes L, Li F, Wu  M, Luo T, Hammarström K, Torell E, Ljuslinder I, Mezheyevski A, Edqvist P-H, Löfgren-Burström A, Zingmark C, Edin S, Larsson C, Mathot L, Osterman E, Osterlund E, Ljungström V, Neves I, Yacoub N, ... Sjöblom T.  Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers. Nature, 2024，633, 137-146.

    2、 Yin J, Yuan J, Li Y, Fang Y, Wang R, Jiao H, Tang H, Zhang S, Lin S, Su F, Gu J, Jiang T, Lin D, Huang Z, Du C, Wu K, Tan L, & Zhou Q. Neoadjuvant adebrelimab in locally advanced resectable esophageal squamous cell carcinoma: A phase 1b trial. Nature Medicine, 2023, 29(8), 2068–2078.

    3、Wang S, Du Y, Zhang B, Meng G, Liu Z, Liew SY, Liang R, Zhang Z, Cai X, Wu S, Gao W, Zhuang D, Zou J, Huang H, Wang M, Wang X, Wang X, Liang T, Liu T, Gu J, Liu N, Wei Y, Ding X, Pu Y, Zhan Y, Luo Y, Sun P, Xie S, Yang J, Weng Y, Zhou C, Wang Z, Wang S, Deng H, Shen Z. Transplantation of chemically induced pluripotent stem-cell-derived islets under abdominal anterior rectus sheath in a type 1 diabetes patient. Cell. 2024 Oct 31;187(22):6152-6164.e18.

    4、  Hua H, Wang Y, Wang X, Wang S, Zhou Y, Liu Y, Liang Z, Ren H, Lu S, Wu S, Jiang Y, Pu Y, Zheng X, Tang C, Shen Z, Li C, Du Y, Deng H. Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells. Cell Stem Cell. 2024 Jun 6;31(6):850-865.e10.

    5、 Qiqi Liu, Mengjie Wang, Xin Dai, Shuangqin Li, Haoxiang Guo, Haozhe Huang, Yueli Xie, Chenlu Xu, Yuan Liu*, WeihongTan. Extreme Tolerance of Nanoparticle-Protein Corona to Ultra-High Abundance Proteins Enhances the Depth of Serum Proteomics. Adv. Sci. 2025,2413713

    6、Yueli Xie, Mengjie Wang, Haoxiang Guo, Baichuan Jin,Chenlu Xu,Xin Dai,Yiyang Fu, Ze Wang, Weizhao Yao, Yuan Liu*, WeihongTan. Protein denaturation for in-depth serum proteome profiling and enhanced cancer diagnosis. Nano Today,2024,59,102488.

    7、Shuangqin Li, Baichuan Jin, Yintao Ma, Xu Yang, Jinlong Fan, Yueli Xie, Chenlu Xu, Xin Dai, Mengjie Wang, Qiqi Liu, Ting Fu, Yuan Liu*, Weihong Tan*. Proteome Fishing for CRISPR/Cas12a-Based Orthogonal Multiplex Aptamer Sensing. J. Am. Chem. Soc. 2024,146,19874.

    8、Lichao Wang, Xu Yang, Yueli Xie, Chenlu Xu, Xin Dai, Mengjie Wang,Yuan Liu*. Nanoparticle protein Corona-Based Tissue Proteomics for the Aging Mouse Proteome Atlas. Anal. Chem. 2024,96,14363.

    9、Mengjie Wang, Xin Dai, Xu Yang, Baichuan Jin, Yueli Xie, Chenlu Xu, Qiqi liu, Lichao Wang, Lisha Ying,Weishan Lu,Qixun Chen,Ting Fu,Dan Su*,Yuan Liu*,and Weihong Tan*. Serum Protein Fishing for Machine Learning Boosted Diagnostic Classification of Small Nodules of Lung. ACS Nano. 2024,18,4038.

    10、Ziming Li; SHR-A1811 (antibody-drug conjugate) in advanced HER2-mutant non-small cell lung cancer: a multicenter, open-label, phase 1/2 study, Signal Transduction and Targeted Therapy, 2024,9(1)

    11、Gao, M.; Liu, Y.; Zhao, L.; Chen, J.; Wan, W.; Yuan, Z.; Li, L.; Huang, Y.; Wang, Y.; Zheng, Y. Cell Surface-Tethered Nucleic Acid Therapeutics Program Robust and Tumor-Responsive Enhancement of Adoptive Cell Therapy. Adv. Mater. 2025, e2419969.

    12、Liu, Y.; Zhang, S.; Zhang, M.; Liu, X.; Wu, Y.; Wu, Q.; Chaput, J. C.; Wang, Y. Chemical Evolution of ASO-like DNAzymes for Effective and Extended Gene Silencing in Cells. Nucleic Acids Res. 2025, 53 (5), gkaf144.

    13、Liu, Y.; Wang, J.; Wu, Y.; Wang, Y. Advancing the Enzymatic Toolkit for 2′-Fluoro Arabino Nucleic Acid (FANA) Manipulation: Phosphorylation, Ligation, Replication, and Templating RNA Transcription. Chem. Sci. 2024, 15 (31), 12534–12542.

    14、Li Z, Song Z, Zhao Y, Wang P, Jiang L, Gong Y, Zhou J, Jian H, Dong X, Zhuang W, Cang S, Yang N, Fang J, Shi J, Lu J, Ma R, Wu P, Zhang Y, Song M, Xu CW, Shi Z, Zhang L, Wang Y, Wang X, Zhang Y, Lu S. D-1553 (garsorasib), a Potent and Selective Inhibitor of KRASG12C in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer: Phase I Study Results. J Thorac Oncol. 2023 Mar 20:S1556-0864(23)00196-X.

    15、 Song Z, Li Y, Chen S, Ying S, Xu S, Huang J, Wu D, Lv D, Bei T, Liu S, Huang X, Xie C, Wu X, Fu J, Hua F, Wang W, Xu C, Gao C, Cai S, Lu S, Zhang Y. Efficacy and safety of pyrotinib in advanced lung adenocarcinoma with HER2 mutations: a multicenter, single-arm, phase II trial. BMC Med. 2022 Feb 1;20(1):42. 

    五、联系与合作

    如果您对我们的研究中心感兴趣或想与我们合作，请随时联系我们。您可以通过以下方式与我们取得联系：

    刘远：liuyuan@him.cas.cn；

    杜媛媛：qinjiangjiang@him.cas.cn；

    宋正波：songzb@zjcc.org.cn；

    王雅俊：wangyajun@him.cas.cn；

    杨磊：yanglei@him.cas.cn；

    董伟：omics@ibmc.ac.cn；


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