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医学所概况

智能分子诊断研究中心

一、研究中心简介

治疗疾病，诊断先行。分子诊断在精准医疗中发挥着重要作用。智能分子诊断中心突出以核酸适体等功能核酸分子探针为特色，面向重大传染病、恶性肿瘤等重大疾病，开展分子诊断和智能诊断设备的科研攻关研究，旨在建立国内外领先的智能分子诊断研究中心，健全难治性恶性肿瘤和重大传染病的分子诊断研究体系，打造国际一流、引领分子诊断研究领域的创新高地。

二、研究方向及内容

（1）分子探针与标志物发现

开发高性能分子探针用于重大疾病的体外诊断与活体成像；通过发展高通量多组学技术与人工智能分析算法等手段鉴定高价值疾病标志物；发展新型化学生物学技术与活体分析技术研究疾病标志物的分子功能与分子机制。 

（2）单分子水平的高灵敏检测

单分子水平的分析和检测代表着化学测量的最高灵敏度，可精准测量低丰度标志物。开发新型单分子检测方法，实现蛋白、核酸等标志物的高灵敏、低成本、高通量的精准检测，并用于标志物发现与临床诊断推广。

（3）智能诊断设备及试剂

在上述疾病标志物发现及针对标志物发展的新型检测分析方法的基础上，进一步研发智能化、便捷式的疾病标志物检测设备和诊断试剂。

三、研究团队

中国科学院杭州医学研究所智能分子诊断研究中心拥有一支在领域内有影响力的科研团队，现有固定人员9人，其中研究员6人，副研究员3人。科研团队中有国家杰青1人、教育部青年长江学者1人、海外优青2人、浙江省卫生高层次创新人才1人。中心组建了一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队和管理队伍。

主要研究团队介绍：

团队一，单分子分析检测团队：聚焦以单分子分析技术、核酸适体为手段的疾病标志物发现及临床诊断；智能化诊断设备和试剂开发等。方晓红研究员为课题组长，主要成员包括蒋逸飞研究员、周卫特聘副研究员、亓鲁滨助理研究员等人。

团队二，液体活检分析团队：以核酸适体等功能核酸探针为分子检测工具，以外泌体、蛋白质及核酸标志物等为检测对象，通过发展标志物精准液体活检新方法与新技术，进行疾病诊断与监测等研究。渠凤丽研究员为课题组长，主要成员包括李进特聘副研究员、郑丽艳助理研究员等。

团队三，肿瘤及传染病诊治团队：通过整合多组学、单细胞图谱、生物分析化学、化学生物学、结构生物学、生信分析等方法开展肿瘤、病毒/细菌感染等的诊断与治疗，并结合人工智能技术发现新靶标及发展治疗新方案。课题组长为王海波研究员，课题组包括博士后多名。

团队四，分子病理诊断及临床转化团队：聚焦肿瘤分子分型与药物伴随诊断标志物研究及其临床转化应用。苏丹研究员为课题组组长，主要成员包括尹文娟副主任医师、应莉莎副研究员、黄丹特聘副研究员、朱蕊特聘副研究员、牛香洁特聘副研究员等。

四、研究成果

1. Jin Li, Yingying Li, Qin Li, Lu Sun, Qingqing Tan, Liyan Zheng, Ye Lu, Jianqing Zhu, Fengli Qu, Weihong Tan. An Aptamer‐Based Nanoflow Cytometry Method for the Molecular Detection and Classification of Ovarian Cancers through Profiling of Tumor Markers on Small Extracellular Vesicles. Angewandte Chemie International Edition, 2024, 63(4): e202314262.

2. Yifei Jiang, Jicheng Zhang, Seung-Ryoung Jung, Haobin Chen, Shihan Xu, Daniel T. Chiu. High-Precision Mapping of Membrane Proteins on Synaptic Vesicles using Spectrally Encoded Super-Resolution Imaging.Angew Chem Int Ed 2023， 62， e202217889.

3. Dachi Wang, Wenxi Wang, Le Fang, Lubin Qi, Yuchao Zhang, Jie Liu, Yuxin Liang, Hongwei Yang, Mengjie Wang, Xiaojian Wei, Ruibin Jiang, Yuan Liu, Wei Zhou*, and Xiaohong Fang. Mitochondrial Protease Targeting Chimeras for Mitochondrial Matrix Protein Degradation. Journal of the American Chemical Society, 2023, 145, 23, 12861-12869.

4. Haibo Wang, Ligang Hu, Hongyan Li, Yau-Tsz Lai, Xueying Wei, Xiaohan Xu, Zhenkun Cao, Huiming Cao, Qianya Wan, Yuen-Yan Chang, Qunfang Zhou, Guibin Jiang, Aimin Xu, Ming-liang He, Hongzhe Sun. Mitochondrial ATP synthase as the first protein target of chromium(III) in alleviating hyperglycaemia. Nature Conmmunications, 2023, 14: 1738. 

5.Wei Zhou, Wenxi Wang, Yuxin Liang, Ruibing Jiang, Fensheng Qiu, Xiying Shao, Yang Liu, Le Fang, Maowei Ni, Chenhuan Yu, Yue Zhao, Weijia Huang, Jiong Li, Michael J. Donovan, Lina Wang, Juan Ni, Dachi Wang, Ting Fu, Jianguo Feng, Xiaojia Wang, Weihong Tan, Xiaohong Fang. The RNA-binding protein LRPPRC promotes resistance to CDK4/6 inhibition in lung Cancer. Nature Communications, 2023, 14, 4212, 2023.

6.Yong-Dan Zhao, Hong-Wei An, Muhetaerjiang Mamuti, Xiang-Zhong Zeng, Rui Zheng, Jia Yang, Wei Zhou, Yuxin Liang, Gege Qin, Da-Yong Hou, Xiaolong Liu, Hao Wang, Yuliang Zhao, Xiaohong Fang. Reprogramming Hypoxic Tumor-associated Macrophages by Nanoglycoclusters for Boosted Cancer Immunotherapy. Advanced Materials, 2023, 2211332, 2023.

7. Ying L, Zhang C, Reuben A, Tian Y, Jin J, Wang C, Bai J, Liu X, Fang J, Feng T, Xu C, Zhu R, Huang M, Lyu Y, Lu T, Pan X, Zhang J, Su D. Immune-active tumor-adjacent tissues are associated with favorable prognosis in stage I lung squamous cell carcinoma. iScience. 2023;26(9):107732.

8. Yang Y, Feng T, Fan X, Wang C, Jiang Y, Zhou X, Bao W, Zhang D, Wang S, Yu J, Tao Y, Song G, Bao H, Yan J, Wu X, Shao Y, Qiu G, Su D, Chen Q. Genomic and Transcriptomic Remodeling by Neoadjuvant Chemoradiotherapy (nCRT) and the Indicative Role of Acquired INDEL Percentage for nCRT Efficacy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2023:S0360-3016(23)00588-6.

9. Yin W, Jin J, Bao H, Chen H, Wang C, Cheng G, Wu C, Wu M, Yan J, Wu X, Shao Y, Ni X, Su D. Tumor-infiltrating lymphocytes-based subtypes and genomic characteristics of EBV-associated lymphoepithelioma-like carcinoma. J Pathol. 2022;257(5):650-662. 

10. Yifei Jiang, Dr. Luca A. Andronico, Dr. Seung-Ryoung Jung, Dr. Haobin Chen, Dr. Bryant Fujimoto, Prof. Lucia Vojtech, Daniel T. Chiu. High-Throughput Counting and Superresolution Mapping of Tetraspanins on Exosomes Using a Single-Molecule Sensitive Flow Technique and Transistor-like Semiconducting Polymer Dots. Angewandte Chemie International Edition. 2021， 60， 13470-13475.

11. Jin Li, Kanyu Xun, Liyan Zheng, Xueyu Peng, Liping Qiu, Weihong Tan. DNA-based dynamic mimicry of membrane proteins for programming adaptive cellular interactions. Journal of the American Chemical Society, 2021, 143(12): 4585-4592.

12. Ying L, Du L, Zou R, Shi L, Zhang N, Jin J, Xu C, Zhang F, Zhu C, Wu J, Chen K, Huang M, Wu Y, Zhang Y, Zheng W, Pan X, Chen B, Lin A, Tam JKC, van Dam RM, Lai DTM, Chia KS, Zhou L, Too HP, Yu H, Mao W, Su D. Development of a serum miRNA panel for detection of early stage non-small cell lung cancer. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020;117(40):25036-25042.

13. Su D, Zhang D, Jin J, Ying L, Han M, Chen K, Li B, Wu J, Xie Z, Zhang F, Lin Y, Cheng G, Li JY, Huang M, Wang J, Wang K, Zhang J, Li F, Xiong L, Futreal A, Mao W. Identification of predictors of drug sensitivity using patient-derived models of esophageal squamous cell carcinoma. Nature Communications. 2019;10(1):5076.

14. Dr. Yifei Jiang, Dr. Qiongzheng Hu, Dr. Haobin Chen, Dr. Jicheng Zhang, Prof. Daniel T. Chiu, Prof. Jason McNeill. Dual-Mode Superresolution Imaging Using Charge Transfer Dynamics in Semiconducting Polymer Dots. Angewandte Chemie International Edition. 2020， 132， 16307-16314.

15.Mohamad Koohi-Moghadam, Haibo Wang, Yuchuan Wang, Xinming Yang, Hongyan Li, Junwen Wang and Hongzhe Sun. Predicting disease-associated mutation of metal-binding sites in proteins using a deep learning approach. Nature Machine Intelligence, 2019, 1, 561–567.

16. Jin Li, Kanyu Xun, Ke Pei, Xiaojing Liu, Xueyu Peng, Yulin Du, Liping Qiu, Weihong Tan. Cell-membrane-anchored DNA nanoplatform for programming cellular interactions. Journal of the American Chemical Society, 2019, 141(45): 18013-18020.

17. Liyan Zheng, Xiaoxiao Hu, Hui Wu, Liuting Mo, Sitao Xie, Jin Li, Cheng Peng, Shujuan Xu, Liping Qiu, Weihong Tan. In vivo monocyte/macrophage-hitchhiked intratumoral accumulation of nanomedicines for enhanced tumor therapy. Journal of the American Chemical Society, 2019, 142(1): 382-391.

五、联系与合作

如果您对我们的研究中心感兴趣或想与我们合作，请随时联系我们。您可以通过以下方式与我们取得联系：

单分子分析检测团队：方老师，xfang@iccas.ac.cn, 电话13910619668或蒋老师jiangyf@ibmc.ac.cn，电话

液体活检分析团队：渠老师，qufengli@him.cas.cn，电话15092797798。

肿瘤及传染病诊治团队：王老师，wanghaibo@him.cas.cn，电话13454402016。

分子病理诊断及临床转化团队：苏老师，sudan@zjcc.org.cn，电话1377746308。

附件下载：

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    人才招聘
    科学研究
    招生教育
    新闻动态
    党群文化
    信息公开

    智能分子诊断研究中心

    一、研究中心简介

    治疗疾病，诊断先行。分子诊断在精准医疗中发挥着重要作用。智能分子诊断中心突出以核酸适体等功能核酸分子探针为特色，面向重大传染病、恶性肿瘤等重大疾病，开展分子诊断和智能诊断设备的科研攻关研究，旨在建立国内外领先的智能分子诊断研究中心，健全难治性恶性肿瘤和重大传染病的分子诊断研究体系，打造国际一流、引领分子诊断研究领域的创新高地。

    二、研究方向及内容

    （1）分子探针与标志物发现

    开发高性能分子探针用于重大疾病的体外诊断与活体成像；通过发展高通量多组学技术与人工智能分析算法等手段鉴定高价值疾病标志物；发展新型化学生物学技术与活体分析技术研究疾病标志物的分子功能与分子机制。 

    （2）单分子水平的高灵敏检测

    单分子水平的分析和检测代表着化学测量的最高灵敏度，可精准测量低丰度标志物。开发新型单分子检测方法，实现蛋白、核酸等标志物的高灵敏、低成本、高通量的精准检测，并用于标志物发现与临床诊断推广。

    （3）智能诊断设备及试剂

    在上述疾病标志物发现及针对标志物发展的新型检测分析方法的基础上，进一步研发智能化、便捷式的疾病标志物检测设备和诊断试剂。

    三、研究团队

    中国科学院杭州医学研究所智能分子诊断研究中心拥有一支在领域内有影响力的科研团队，现有固定人员9人，其中研究员6人，副研究员3人。科研团队中有国家杰青1人、教育部青年长江学者1人、海外优青2人、浙江省卫生高层次创新人才1人。中心组建了一支结构合理、素质优良、具有较强竞争力和持续发展能力的科技人才团队和管理队伍。

    主要研究团队介绍：

    团队一，单分子分析检测团队：聚焦以单分子分析技术、核酸适体为手段的疾病标志物发现及临床诊断；智能化诊断设备和试剂开发等。方晓红研究员为课题组长，主要成员包括蒋逸飞研究员、周卫特聘副研究员、亓鲁滨助理研究员等人。

    团队二，液体活检分析团队：以核酸适体等功能核酸探针为分子检测工具，以外泌体、蛋白质及核酸标志物等为检测对象，通过发展标志物精准液体活检新方法与新技术，进行疾病诊断与监测等研究。渠凤丽研究员为课题组长，主要成员包括李进特聘副研究员、郑丽艳助理研究员等。

    团队三，肿瘤及传染病诊治团队：通过整合多组学、单细胞图谱、生物分析化学、化学生物学、结构生物学、生信分析等方法开展肿瘤、病毒/细菌感染等的诊断与治疗，并结合人工智能技术发现新靶标及发展治疗新方案。课题组长为王海波研究员，课题组包括博士后多名。

    团队四，分子病理诊断及临床转化团队：聚焦肿瘤分子分型与药物伴随诊断标志物研究及其临床转化应用。苏丹研究员为课题组组长，主要成员包括尹文娟副主任医师、应莉莎副研究员、黄丹特聘副研究员、朱蕊特聘副研究员、牛香洁特聘副研究员等。

    四、研究成果

    1. Jin Li, Yingying Li, Qin Li, Lu Sun, Qingqing Tan, Liyan Zheng, Ye Lu, Jianqing Zhu, Fengli Qu, Weihong Tan. An Aptamer‐Based Nanoflow Cytometry Method for the Molecular Detection and Classification of Ovarian Cancers through Profiling of Tumor Markers on Small Extracellular Vesicles. Angewandte Chemie International Edition, 2024, 63(4): e202314262.

    2. Yifei Jiang, Jicheng Zhang, Seung-Ryoung Jung, Haobin Chen, Shihan Xu, Daniel T. Chiu. High-Precision Mapping of Membrane Proteins on Synaptic Vesicles using Spectrally Encoded Super-Resolution Imaging.Angew Chem Int Ed 2023， 62， e202217889.

    3. Dachi Wang, Wenxi Wang, Le Fang, Lubin Qi, Yuchao Zhang, Jie Liu, Yuxin Liang, Hongwei Yang, Mengjie Wang, Xiaojian Wei, Ruibin Jiang, Yuan Liu, Wei Zhou*, and Xiaohong Fang. Mitochondrial Protease Targeting Chimeras for Mitochondrial Matrix Protein Degradation. Journal of the American Chemical Society, 2023, 145, 23, 12861-12869.

    4. Haibo Wang, Ligang Hu, Hongyan Li, Yau-Tsz Lai, Xueying Wei, Xiaohan Xu, Zhenkun Cao, Huiming Cao, Qianya Wan, Yuen-Yan Chang, Qunfang Zhou, Guibin Jiang, Aimin Xu, Ming-liang He, Hongzhe Sun. Mitochondrial ATP synthase as the first protein target of chromium(III) in alleviating hyperglycaemia. Nature Conmmunications, 2023, 14: 1738. 

    5.Wei Zhou, Wenxi Wang, Yuxin Liang, Ruibing Jiang, Fensheng Qiu, Xiying Shao, Yang Liu, Le Fang, Maowei Ni, Chenhuan Yu, Yue Zhao, Weijia Huang, Jiong Li, Michael J. Donovan, Lina Wang, Juan Ni, Dachi Wang, Ting Fu, Jianguo Feng, Xiaojia Wang, Weihong Tan, Xiaohong Fang. The RNA-binding protein LRPPRC promotes resistance to CDK4/6 inhibition in lung Cancer. Nature Communications, 2023, 14, 4212, 2023.

    6.Yong-Dan Zhao, Hong-Wei An, Muhetaerjiang Mamuti, Xiang-Zhong Zeng, Rui Zheng, Jia Yang, Wei Zhou, Yuxin Liang, Gege Qin, Da-Yong Hou, Xiaolong Liu, Hao Wang, Yuliang Zhao, Xiaohong Fang. Reprogramming Hypoxic Tumor-associated Macrophages by Nanoglycoclusters for Boosted Cancer Immunotherapy. Advanced Materials, 2023, 2211332, 2023.

    7. Ying L, Zhang C, Reuben A, Tian Y, Jin J, Wang C, Bai J, Liu X, Fang J, Feng T, Xu C, Zhu R, Huang M, Lyu Y, Lu T, Pan X, Zhang J, Su D. Immune-active tumor-adjacent tissues are associated with favorable prognosis in stage I lung squamous cell carcinoma. iScience. 2023;26(9):107732.

    8. Yang Y, Feng T, Fan X, Wang C, Jiang Y, Zhou X, Bao W, Zhang D, Wang S, Yu J, Tao Y, Song G, Bao H, Yan J, Wu X, Shao Y, Qiu G, Su D, Chen Q. Genomic and Transcriptomic Remodeling by Neoadjuvant Chemoradiotherapy (nCRT) and the Indicative Role of Acquired INDEL Percentage for nCRT Efficacy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2023:S0360-3016(23)00588-6.

    9. Yin W, Jin J, Bao H, Chen H, Wang C, Cheng G, Wu C, Wu M, Yan J, Wu X, Shao Y, Ni X, Su D. Tumor-infiltrating lymphocytes-based subtypes and genomic characteristics of EBV-associated lymphoepithelioma-like carcinoma. J Pathol. 2022;257(5):650-662. 

    10. Yifei Jiang, Dr. Luca A. Andronico, Dr. Seung-Ryoung Jung, Dr. Haobin Chen, Dr. Bryant Fujimoto, Prof. Lucia Vojtech, Daniel T. Chiu. High-Throughput Counting and Superresolution Mapping of Tetraspanins on Exosomes Using a Single-Molecule Sensitive Flow Technique and Transistor-like Semiconducting Polymer Dots. Angewandte Chemie International Edition. 2021， 60， 13470-13475.

    11. Jin Li, Kanyu Xun, Liyan Zheng, Xueyu Peng, Liping Qiu, Weihong Tan. DNA-based dynamic mimicry of membrane proteins for programming adaptive cellular interactions. Journal of the American Chemical Society, 2021, 143(12): 4585-4592.

    12. Ying L, Du L, Zou R, Shi L, Zhang N, Jin J, Xu C, Zhang F, Zhu C, Wu J, Chen K, Huang M, Wu Y, Zhang Y, Zheng W, Pan X, Chen B, Lin A, Tam JKC, van Dam RM, Lai DTM, Chia KS, Zhou L, Too HP, Yu H, Mao W, Su D. Development of a serum miRNA panel for detection of early stage non-small cell lung cancer. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020;117(40):25036-25042.

    13. Su D, Zhang D, Jin J, Ying L, Han M, Chen K, Li B, Wu J, Xie Z, Zhang F, Lin Y, Cheng G, Li JY, Huang M, Wang J, Wang K, Zhang J, Li F, Xiong L, Futreal A, Mao W. Identification of predictors of drug sensitivity using patient-derived models of esophageal squamous cell carcinoma. Nature Communications. 2019;10(1):5076.

    14. Dr. Yifei Jiang, Dr. Qiongzheng Hu, Dr. Haobin Chen, Dr. Jicheng Zhang, Prof. Daniel T. Chiu, Prof. Jason McNeill. Dual-Mode Superresolution Imaging Using Charge Transfer Dynamics in Semiconducting Polymer Dots. Angewandte Chemie International Edition. 2020， 132， 16307-16314.

    15.Mohamad Koohi-Moghadam, Haibo Wang, Yuchuan Wang, Xinming Yang, Hongyan Li, Junwen Wang and Hongzhe Sun. Predicting disease-associated mutation of metal-binding sites in proteins using a deep learning approach. Nature Machine Intelligence, 2019, 1, 561–567.

    16. Jin Li, Kanyu Xun, Ke Pei, Xiaojing Liu, Xueyu Peng, Yulin Du, Liping Qiu, Weihong Tan. Cell-membrane-anchored DNA nanoplatform for programming cellular interactions. Journal of the American Chemical Society, 2019, 141(45): 18013-18020.

    17. Liyan Zheng, Xiaoxiao Hu, Hui Wu, Liuting Mo, Sitao Xie, Jin Li, Cheng Peng, Shujuan Xu, Liping Qiu, Weihong Tan. In vivo monocyte/macrophage-hitchhiked intratumoral accumulation of nanomedicines for enhanced tumor therapy. Journal of the American Chemical Society, 2019, 142(1): 382-391.

    五、联系与合作

    如果您对我们的研究中心感兴趣或想与我们合作，请随时联系我们。您可以通过以下方式与我们取得联系：

    单分子分析检测团队：方老师，xfang@iccas.ac.cn, 电话13910619668或蒋老师jiangyf@ibmc.ac.cn，电话

    液体活检分析团队：渠老师，qufengli@him.cas.cn，电话15092797798。

    肿瘤及传染病诊治团队：王老师，wanghaibo@him.cas.cn，电话13454402016。

    分子病理诊断及临床转化团队：苏老师，sudan@zjcc.org.cn，电话1377746308。

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