陈广勇
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个人简历
特聘研究员 ，杭州市海外高层次人才。曾任之江实验室生命科学计算研究中心副主任，中国科学院深圳先进技术研究院副研究员，腾讯量子实验室高级研究员，并在香港中文大学 计算机科学与工程系获得博士学位，在南京大学电子科学与工程学院获得学士学位。聚焦研发以大模型技术为代表的 人工智能 技术处理生命科学数据，从头设计功能生物分子；先后主持科技部重点研发计划国际合作重点项目、国自然专项项目及面上等多项国家级项目；以第一作者和通讯作者的身份，在《Nature Machine Intelligence》、《Nature Computational Science》、《Nature Communication》、ICML、ICLR、NeurIPS等知名期刊和会议上发表了40余篇论文。
研究方向
聚焦研发以大模型技术为代表的 人工智能 技术处理生命科学数据，从头设计功能生物分子
承担科研项目情况
1. 基于多元约束扩散模型的分子虚拟生成，国家自然科学基金面上项目，2024-01-01至2027-12-31，50万
2. 核酸适体药物序列-结构协同设计的预训练基座模型 开发与论证（联合申请B），国家自然科学基金专项项目，2024-01-01至2026-12-31，100万
3. 面向言语障碍(残疾)儿童的功能评估、康复及语言交流辅助技术研究，国家重点研发计划青年科学家项目，2025-09至2028-08，90万
代表论著
1. Xujun Zhang, Odin Zhang, Chao Shen, Wanglin Qu, Shicheng Chen, Hanqun Cao, Yu Kang, Zhe Wang, Ercheng Wang, Jintu Zhang, Yafeng Deng, Furui Liu, Tianyue Wang, Hongyan Du, Langcheng Wang, Peichen Pan*, Guangyong Chen*, Chang-Yu Hsieh* & Tingjun Hou*. Efficient and accurate large library ligand docking with KarmaDock[J]. Nature Computational Science, 2023, 3(9): 789-804. (IF=18.3)
2. Odin Zhang, Jintu Zhang, Jieyu Jin, Xujun Zhang, RenLing Hu, Chao Shen, Hanqun Cao, Hongyan Du, Yu Kang, Yafeng Deng, Furui Liu*, Guangyong Chen*, Chang-Yu Hsieh* & Tingjun Hou*. ResGen is a pocket-aware 3D molecular generation model based on parallel multiscale modelling[J]. Nature Machine Intelligence, 2023, 5(9): 1020-1030. (IF=23.9)
3. Xinyi Zhou, Guangyong Chen*, Junjie Ye, Ercheng Wang, Jun Zhang, Cong Mao, Zhanwei Li, Jianye Hao, Xingxu Huang, Jin Tang & Pheng Ann Heng. ProRefiner: an entropy-based refining strategy for inverse protein folding with global graph attention[J]. Nature Communications, 2023, 14(1): 7434. (IF=15.7)
4. Jia-Min Lu, Hui-Feng Wang, Qi-Hang Guo, Jian-Wei Wang, Tong-Tong Li, Ke-Xin Chen, Meng-Ting Zhang, Jian-Bo Chen, Qian-Nuan Shi, Yi Huang, Shao-Wen Shi, Guang-Yong Chen*, Jian-Zhang Pan*, Zhan Lu* & Qun Fang*. Roboticized AI-assisted microfluidic photocatalytic synthesis and screening up to 10,000 reactions per day[J]. Nature Communications, 2024, 15(1): 1-13. (IF=15.7)
5. Liqi Wan, Chengwei Zhang, Yu Liu, Jiacheng Zhang, Lei He, Yuchao Zhang, Guangyong Chen*, Pei Guo*, and Da Han*. Small CAG Repeat RNA Forms a Duplex Structure with Sticky Ends That Promote RNA Condensation[J]. Journal of the American Chemical Society, 2025, 147(4): 3813-3822. (IF=15.6)
6. Bowen Wang, Junyou Li, Donghao Zhou, Lanqing Li, Jinpeng Li, Ercheng Wang, Jianye Hao, Liang Shi, Chengqiang Lu, Jiezhong Qiu, Tingjun Hou, Dongsheng Cao, Guangyong Chen & Pheng Ann Heng. Unified and explainable molecular representation learning for imperfectly annotated data from the hypergraph view[J]. Nature Communications, 2025, 16(1): 1-18. (IF=15.7)
7. Danruo Deng, Wuqin Xu, Bian Wu, Hans Peter Comes, Yu Feng, Pan Li, Jinfang Zheng, Guangyong Chen & Pheng-Ann Heng. PhyloTune: An efficient method to accelerate phylogenetic updates using a pretrained DNA language model[J]. Nature Communications, 2025, 16(1): 6905. (IF=15.7)
8.《计算制药》，陈广勇, 段宏亮，浙江大学出版社，版次88，2022
获奖及荣誉
1.一种数据可视化处理方法、装置及存储介质，上海交通大学；腾讯科技（深圳）有限公司（李琦; 傅洛伊; 王新兵; 陈广勇; 張勝譽），CN201911212122.6，2023-04-28
2.一种多智能体系统的网络参数更新方法、装置及终端设备，中国科学院深圳先进技术研究院（陈广勇; 董一臻; 郝建业; 王琼; 王平安），CN202011364310.3，2024-10-01
3.一种图像超分辨率方法、装置、终端设备和存储介质，中国科学院深圳先进技术研究院（廖祥云; 王琼; 陈广勇; 王平安），CN202011319016.0，2024-03-29
4.基于预设的损失函数的单目深度估计网络的训练方法，中国科学院深圳先进技术研究院（沈贵宝; 王琼; 陈广勇; 王平安），CN202110728310.5，2024-05-03
5.一种细胞检测数据预处理方法、装置及存储介质，之江实验室（张秋云; 许吾琴; 郑进芳; 陈广勇; 刘扶芮），CN202410189827.5，2024-03-22
6.一种数据处理的方法、装置、存储介质及电子设备，之江实验室（张秋云; 许吾琴; 郑进芳; 陈广勇），CN202410189826.0，2024-05-03
7.一种基于分布匹配的药物-药物相互作用预测方法及装置，之江实验室（李翠玉; 李俊友; 王二成; 陈广勇; 李蓝青），CN202411215460.6，2024-11-09
8.一种基于人工智能算法的高精度单细胞分类方法和装置，之江实验室（陈高祥; 谢彬; 阮涛; 骆正阳; 侯丽亚; 冯琳清; 刘永强; 傅帅; 陈广勇; 张华为），CN202411617083.9，2025-02-11
