张亮
计算机科学(人工智能)博士,在美国硅谷、英国伦敦、中国香港学习工作超过15年,拥有科研和工业界经验。曾任职百度美国研究院,获得百度最高级别技术奖项和入围百度最高奖前十名。以第一或通讯(含共同)身份在Nature发表人工智能药物研发算法LinearDesign,在Molecular Therapy发表AI传染病疫苗文章;参与的文章已被Cell、PNAS、NAR等刊物发表;所设计的新冠疫苗已在海外上市并完成临床三期试验;所开发新冠病毒溯源分析软件已在中国疾控中心部署,用于对抗新冠疫情。申请多项中美日欧专利。主持国家自然科学基金面上、国家重点研发课题等。
主要研究方向为人工智能+药物研发与临床转化:
1. 世界领先的AI核酸药物设计算法:开发AI药物设计算法LinearDesign已在Nature发表,该算法成功解决了长期困扰RNA药物研发的稳定性差这一技术瓶颈。算法基于自然语言处理技术,首次实现了对人类从未达到过的mRNA设计空间的探索,同时实现了对mRNA分子稳定性、蛋白翻译效率、结构等影响其可成药性的关键特征的联合优化。Nature连续发表两篇评论文章介绍LinearDesign工作。算法吸引了麻省理工科技评论、新浪、搜狐等数十家媒体报道。LinearDesign已授权法国赛诺菲用于其全线mRNA管线研发,并已有超过50家国内外药企和科研院所使用该算法开发药物。
2. 药物管线研发:申请人设计的新冠疫苗已在海外紧急上市并完成临床三期;设计的肿瘤新抗原疫苗已完成临床一期;开发的带状疱疹、狂犬等传染病疫苗已完成安全评估。
3. ITBT(信息科技+生物科技)平台开发:参与开发新冠病毒溯源分析平台Covseq已在中国疾控中心病毒所部署,对抗疫情;开发百度AI生物计算平台PaddleHelix,用于药物研发。平台基于百度人工智能深度学习框架PaddlePaddle开发,支持用户开发新的分子和对新药药效进行自动化分析。上述平台均实现商业化。
(1) 国家自然科学基金面上项目, 主持,2025--2028
(2) 国家重点研发计划,合成生物学,课题主持,2024-2029
(3)国家重点研发计划,合成生物学,骨干,2024-2029
(4)国自然盖茨基金会项目,课题主持,2024-2026
Algorithm for optimized mRNA design improves stability and immunogenicity, Nature, 2023, 共一
A Nucleoside-Modified Rabies mRNA Vaccine Induces Long-Lasting and Comprehensive Immune Responses in Mice and Non-Human Primates, Molecular Therapy, 2025, 通讯
siRNADiscovery: A Graph Neural Network for siRNA Efficacy Prediction via Deep RNA Sequence Analysis, Briefings in Bioinformatics, 2024, 通讯
LinearAlifold: Linear-time consensus structure prediction for RNA alignments, Journal of Molecular Biology, 2024, 共一
Linear-Time Algorithms for RNA Structure Prediction, Methods in Molecular Biology,Humana, New York, NY, 2022-07
m6A-modified cenRNA stabilizes CENPA to ensure centromere integrity in cancer cells, Cell, 2024
百度总技术委员会(TC)技术创新奖